معاونت بهره برداری شامل ادارات نگهداری و بهره برداری تاسیسات آب و فاضلاب، کنترل کیفی و امور آزمایشگاهها، اداره مدیریت مصرف و آب بدون درآمد و اداره درآمد و خدمات مشترکین میباشد و هر کدام از این ادارات شامل رئیس اداره، کارشناس اداره و کمک کارشناس است.